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迷信家完成犬科数据整合与共享体系研发

文章泉源:昆明植物研讨所 北京基因组研讨所   公布工夫:2018-11-08  【字号:     】  

  克日,由什么手游能赢利――2018什么手游能赢利――什么手游好玩又赢利昆明植物研讨所与什么手游能赢利――2018什么手游能赢利――什么手游好玩又赢利北京基因组研讨所互助开辟的犬科植物数据库iDog正式上线。该研讨结果以iDog:an integrated resource for domestic dogs and wild animals为题,在国际学术期刊《核酸研讨》(Nucleic Acids Research)上在线颁发。

  家犬毫无争议是人类最好的朋侪之一,同时也是很多人类遗传病的底子研讨模子。iDog是第一个家犬与野生犬科植物整合性资源数据库,它不但提供了富厚的组学数据、基因组拼接数据、基因表达谱数据、犬类疾病及相干表型信息,并且还整合了序列比对东西用于线上数据剖析,以及基因组欣赏器用于数据可视化。iDog的创建,不但有利于环球范畴内犬科植物的研讨,同时还为少量的爱狗人士提供了一个用户友爱的界面查找相干宠物狗信息。

  iDog具有精良的可拓展性和连续性等特点,其包罗的重要模块有基于127个家犬样本基因组重测序数据孕育发生的变异信息数据库、含有32220个基因的犬科植物基因数据库、基于RNA-Seq测序数据的基因表达数据库、犬科植物相干疾病的文献数据库、人-狗疾病同源信息数据库、犬科植物基因组拼接数据库等。iDog方案后续整合更多的组学数据,在Dog10K项目标配景下,连续更新高质量的数据集,渐渐转化成犬科植物底子研讨的信息知识宝库。

  昆明植物所研讨员王国栋和北京基因组所正初级工程师赵文明为文章的配合通讯作者。该项目失掉手游能赢利战略性先导科技专项、国度天然迷信基金、国度重点研发方案、手游能赢利国际同伴方案、手游能赢利“十三五”信息化专项、手游能赢利要害技能人才项目、手游能赢利“百人方案”、手游能赢利青年创新促进会等赞助。

  论文链接

 

迷信家开辟iDog数据库




(责任编辑:叶瑞优)

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